An der Hochschule für Musik Trossingen kann man den Masterstudiengang Musik mit künstlerischer und künstlerisch-pädagogischer Vertiefung studieren. Es werden auch künstlerische weiterbildende Masterstudiengänge wie Lied, Orchester, Oper, Vokalensemble, Ensembleleitung, Neue Musik, Performance sowie künstlerisch-pädagogische Studiengänge wie Musikvermittlung, Klassenmusizieren und Musik für Menschen im 3. und 4. Lebensabschnitt angeboten. In den Bereichen Alte Musik und Musik und Bewegung sind weitere Vertiefungen und Spezialisierungen möglich. Der wissenschaftliche Master-Studiengang Musikwissenschaft wird als Master of Arts angeboten.
Die meisten Masterstudiengänge sind auf zwei Jahre (120 Leistungspunkte) ausgelegt und ermöglichen ein profundes Wissen in neuen Fachgebieten und Kompetenzfeldern. Die Masterstudiengänge Klassenmusizieren sowie Musik für Menschen im 3. und 4. Lebensabschnitt konzentrieren sich auf ein abgegrenztes, zielgruppenorientiertes Kompetenzspektrum, das in einem Studienjahr und einem Umfang von 60 Leistungspunkten absolviert werden kann.
Folgende Masterstudiengänge werden angeboten:
Es können Masterstudiengänge mit Streichinstrumenten, Blasinstrumenten, Akkordinstrumente belegt werden.